L’intrapresa di una coltivazione di microalghe, da sole o in combinazione con altri microrganismi, richiede dall’inizio scelte impegnative e ad alto impatto per lo sviluppo del progetto. Esse vanno dalla scelta della tipologia (autotrofiche, eterotrofiche, miste), e dei ceppi, ai sistemi utilizzati, infine alle strategie, per esempio se puntare sull’estrazione delle sostanze d’interesse o sull’utilizzo della biomassa intera.